ぬか床の表面が黒い、これなに？

ぬか床の表面が酸化しているだけ。

ぬかはミネラル分（鉄分やカルシウムなど）が豊富で、こうしたものが酸素と結合して、黒みを帯びるのである。

黒カビでないならそのままかきまぜてしまって大丈夫。かきまぜたあとは、表面をひららかにして、空気との接触面積をなるたけ減らすようにするといい。